Die Fellfarben des Spanischen Mustangs sind weit gefächert, und viele amerikanische Pferderassen haben ihre farbliche Vielfalt dem Einfluss der Mustangs zu verdanken. Es gibt Mustangs in den bekannten Grundfarben: Rappe, Brauner, Fuchs und Schimmel, aber auch Sorrel, Grullo, Zebra, Dun, Buckskin, Palomino und Cream. Bei vielen Pferden ist die Grundfarbe mit Weiß kombiniert, daraus resultieren verschiedene Schimmel-Versionen, Roans (Stichelhaarige) und Schecken (Tobiano, Overo, Calico und Leopardenschecken, wie für gewöhnlich mit dem Appaloosa assiziiert werden).